В секретном бюро ЦРУ в Праге завёлся «крот» — двойной агент. Для того, чтобы его найти и нейтрализовать, планируется операция с фиктивным похищением секретных списков спецагентов под прикрытием. Тщательно спланированная операция идет успешно, но неожиданно в ходе операции все агенты гибнут, а единственным случайно выжившим агентом остается главный герой Итан (Том Круз). Разумеется, все подозрения в провале миссии автоматически падают на него, заставляя Итана уйти в тень преступного мира.
Итан через интернет находит нанимателя "крота" и зная только кличку спецагента, предлагает сделку, в ходе которой обещает якобы предоставить подлинный список спецагентов в обмен на настоящее имя предателя и сумму в десять миллионов долларов.
Собрав старую команду своих самых преданных друзей, профессионалов своего дела, спецагент решает провести сделку по передаче секретной дискеты в суперсовременном скоростном поезде, направляющемся из Лондона в Париж. Но "крот" не дремлет и тоже охотится за дискетой, устраивая в поезде ловушку Итану.
Теперь Итану необходимо найти и обезвредить настоящего"крота", чтобы вернуть своё честное имя и отомстить...