Ещё в детстве Индиана проявил способности настоящего искателя сокровищ, наследованные от своего отца, такого же любителя приключений и древних артефактов.
Спустя много лет к уже опытному археологу, которым стал мальчик, приходит посылка из далекой Венеции. Индиана узнаёт, что его отец, Джонс-старший, все свои исследования и всю свою жизнь посвятивший поискам священной чаши Грааля, очень близок к разгадке тайны и приглашает его к себе. К тому же Индиана получает странное и захватывающее предложение от одного бизнесмена. Тот утверждает, что нашел ключ к местоположению чаши Грааля, но кусок таблички с картой отколот и надо найти недостающую часть.
Отправившись в Венецию, Индиана находит дом отца разграбленным, а библиотеку разгромленной и пустой.
Найдя в городе бывшую ассистентку своего отца, очаровательную и умную красавицу Эльзу, Индиана вместе с ней отправляется в Альпы, где по словам девушки нацисты содержат Джонса-старшего, чтобы заставить того найти для них столь желанный артефакт.
Но, кроме освобождения Джонса-старшего есть и еще одна весьма опасная и ответственная задача. Надо помешать нацистам и опередить их, ведь тот, кто завладеет чашей, получит власть над миром...